Wieder wird eine Schulklasse vom Militär ausgewählt und auf eine Insel geschickt. Diesmal sollen sich die Schüler Nanahara Shuya, den Gewinner des vergangenen Battle Royale, jagen und eliminieren. Nanahara hat die regierungsfeindliche Terrorgruppe Wild Seven ins Leben gerufen und kämpft mit einer Gruppe Unerschrockener gegen die japanische Regierung und den totalitären Superstaat, der hinter ihr steht.